Özel haritalar oyuncuya özel oluşturulmuş haritalardır. Özel haritalara girebilmek için ilgili haritayla ilgili harita parçaları toplanmış olmalıdır. Özel harita tamamlandığında bu harita parçaları yok olur ve tekrar oynayabilmek için tekrardan harita parçası toplamak gerekir. Oyuncular bu haritalarda sistem gemilerine karşı tek başlarına mücadele ederler. Bu haritalar belli sayıda saldırı dalgalarından oluşmaktadır. Her dalgada belli bir sayıda sistem gemisi size saldırır. Bir saldırı dalgasındaki tüm sistem gemileri batırıldığı anda bir sonraki saldırı dalgası başlar. Özel haritada iken herhangi bir nedenle haritadan çıkarsanız bir sonraki girişinizde en son bitirdiğiniz saldırı dalgasının başından başlarsınız.